南京BD单细胞多组学

单细胞测序技术（SingleCellSequencing）从一种新兴的研究角度，借助已有的高通量测序手段，帮助研究者在疾病样本的异质性、样本微环境、发育学、免疫学以及其他领域中进行单细胞层面的数据解析，解决了BulkPopulationSequencing所无法解决的问题。这样一个新的研究领域必然也需要足够可靠的实验手段来支撑。BDRhapsody单细胞分选系统为此提供了完善的硬件设备，保证了从单细胞悬液质量评估到单细胞分选标记过程中每一个实验步骤的完善质控。NovelBio单细胞实验团队借助BDRhapsody单细胞分选系统，在实验实施层面对单细胞测序结果的可靠性提供了强有力的保证。继单细胞悬液制备之后，又在另一道关键关卡提供了可靠的支持，帮助研究者在单细胞测序领域收获更多的成果。单细胞多组学测序技术提供了全新的视角来分析细胞的分化路径、细胞间的交互调控和细胞亚群的分离现象。南京BD单细胞多组学

基于桥式PCR技术的簇生成可以将模版链迅速扩增成千上万倍，保证过程中足够的测序深度。测序时使用特殊标记的dNTP：1）碱基上通过敏感键修饰上不同的荧光基团，用于区分ATCG；2）3端使用叠氮基团封闭，保证一次循环只上一个dNTP。每一轮循环结束时，会通过高速荧光显微镜记录荧光图像，再通入试剂除去荧光基团和叠氮基团，开启下一循环。通过分析读取同一位点的荧光，实时获取模版链的碱基序列。由于过程中使用的化学反应并不可控，随着循环数的增大会出现不同步的情况，因此Illumina的读长只能限制在200bp左右。青岛scRNA单细胞多组学数据分析可视化目前单细胞多组学技术仍然处于技术探索及高通量开发阶段,但应用单细胞多组学分析是研究发展的必然趋势。

烈冰生物生信分析团队紧追国际前沿、整合添加多项国际期刊认可的空转分析工具，构建一套完整的数据分析流程；精心研发空转结果浏览器，可同步展示空间转录组与单细胞测序分析结果，详细深入地解析空间转录组数据。完成从Rawdata（原始数据）到Spot-Gene的具有定位信息的表达矩阵的过程后，就进入了空转的第二步，去进行Spot的Cluster的过程，熟悉单细胞测序的研究者知道，Cluster在单细胞测序中往往表示为细胞的类型，也就是说能聚在一起采用算法分为一个群体细胞是一个Celltype（当然分情况也会有不同）。而在空转中，也正是由于前面提到了细胞的非单一性，导致了这里的分群并不是单纯的同一细胞类型，而应该认为是具有相同细胞组成的点阵区域，或者说是近似的组织结构区域。

二代测序技术在测序方法上取得了重大突破，基于“边合成边测序”（sequencingbysynthesis）和大规模平行测序技术（massiveparallelanalysis,MPS），使测序通量和读取速度得到极大提升，烈冰生物斥巨资购置的Novaseq6000测序仪的测序原理可以简化为四步：样品文库构建、簇生成、测序和数据分析。由于读长限制，样品DNA或由RNA逆转录得到的cDNA需要被打断成300-500bp的片段，并在3和5端接上3种序列：1）Index，用于区分样品来源；2）Adapter，用于结合测序通道上的位点；3）Primerbindingsite，用于结合PCR引物启动扩增反应。单细胞组学通过一系列测序技术实现高分辨检测单个细胞水平表达谱,以解析细胞异质性及其功能表型。

空间转录组测序与单细胞测序的结果不同，这里存在一个概念叫做NumberofSpotsundertissue，即，空间转录组片子上组织覆盖的有效的spot位点。这个有效Spot的筛选标准是有UMI以及有序列表达。那么这个时候，贴片的质量就成为了制约空间转录组有效区域的要点了。如果组织没有很好地覆盖到空转片上，那么容易出现虽然有HE染色有组织片子，但是没有基因表达，即无有效Spot位点。同样的，另一个就是组织切片的大小，也就是说组织切片在整个玻片的覆盖面积越小，分析的有效区域就越少。这两者基本上决定了整个空间转录组分析结果的基础质量。单细胞测序技术提供了单个细胞水平下的科学研究视角。无锡single cell RNA单细胞多组学数据分析可视化

单细胞多组学测序主要包含细胞分离、文库构建、高通量测序和生物信息学分析等步骤。南京BD单细胞多组学

单细胞测序是指针对单个细胞进行全转录组测序分析，可精确地描述每一个细胞的状态，在异质性发育过程中具有不可忽视的应用价值。然而，单细胞测序无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息，对于揭示发育过程、病理微环境都存在很大的局限性。空间转录组测序以点阵形式记录病理切片细胞的空间信息并进行测序，可以精确指示点阵内的全部基因表达情况。空间转录组测序的加入，无疑让单细胞测序如虎添翼，更精确地勾勒了组织水平的异质性。南京BD单细胞多组学

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